KiCad 5.1.6
Symbol Editorを開く。

既存のシンボルを読み込む。
選んでダブルクリックする。

読み込まれる。

自分のライブラリに保存する。

ライブラリ名を選んでダブルクリックする。

編集する。
ここでは、実際のピン配置に合わせたレイアウトにしてみた。

Save all changesをクリックする。

オリジナル、変更後ともに読み込むことができる。

新しいライブラリを作成してそこに保存することもできる。
NewとAddの違いがよくわからない。

オリジナル、新規のライブラリ、以前からの自分用のライブラリの3つに保存されている。

プロジェクト固有のシンボルなら新しいライブラリにしてプロジェクト・フォルダに置いとけばいいかも。

追記(2020/10/12)
Save copy asで先にコピー作って編集後に再度保存でもいいかも。
